Frank Ebert est né à Halle en 1970. À la fin des années 1980, il est membre du groupe d'opposants Umweltbibliothek (UB) où il fait office d’imprimeur et d’archiviste pour différents samizdats. Il organise de nombreuses actions de l’opposition à Berlin (rassemblements, manifestations, distribution de tracts). En 1990, il fait partie des comités de citoyens qui occupent le siège du MfS à Berlin afin d’empêcher la destruction des dossiers de la Stasi. Après la réunification, il est l’un des membres fondateurs de la Fondation Robert-Havemann (Robert-Havemann-Gesellschaft) à Berlin où il travaille principalement comme archiviste.